そういや、CygwinのOfficialパッケージにX11R6が含まれるようになりましたね。釈迦に説法かもしれませんが、どやって使うねん!とか吼えてる人は
/usr/X11R6/bin/startxwin.sh
を実行してみては?
なんかIIOSSなるソフト使ってる。あー、、、先生が一人で暴走してるよ;;